Les objectifs d’une plateforme de bioinformatique sont multiples et visent généralement à faciliter l’analyse et l’interprétation des données biologiques, en particulier celles générées par des technologies de séquençage de l’ADN et de l’ARN mais aussi de la protéomique. Quant à la science des données, la plateforme a pour objectifs principaux de faciliter :
- L’analyse de données avancées ;
- L’exploration des données ;
- Le nettoyage et le prétraitement des données ;
- La visualisation des données;
- Le développement d’algorithmes personnalisés ;
- L’intégration de données hétérogènes ;
- La sécurité et confidentialité des données.
PRESTATIONS POUVANT ÊTRE FAITES PAR LA PLATEFORME
- Analyse de séquences génomiques pour l’identification et annotation des gènes, recherche de variations génétiques telles que les SNP (polymorphismes nucléotidiques simples) et les indels (insertions et délétions), prédiction des régions codantes et non codantes ;
- Génomique comparative et évolutive pour des séquences biologiques d’origine diverse ;
- Analyse métagénomique pour l’identification et classification des microorganismes présents dans des échantillons biologiques « microbiome », étude de la diversité microbienne des microbiotes, prédiction des fonctions microbiennes et des interactions écologiques ;
- Modélisation et prédiction de la structure tridimensionnelle des protéines, analyse de la structure et de la fonction des macromolécules biologiques, prédiction des interactions moléculaires et des sites de liaison ;
- Structuration et analyse statistique, intégration et visualisation des données.
